中央部门所属高校国家励志奖学金所需资金由中央负担。地方所属高校国家励志奖学金所需资金根据各地财力及生源状况由中央与地方按比例分担。其中，西部地区，不分生源，中央与地方分担比例为８∶２；中部地区，生源为西部地区的，中央与地方分担比例为８∶２，生源为其他地区的，中央与地方分担比例为６∶４；东部地区，生源为西部地区和中部地区的，中央与地方分担比例分别为８∶２和６∶４，生源为东部地区的，中央与地方分担比例根据财力及生源状况等因素分省确定。人口较少民族家庭经济困难学生资助资金全部由中央负担。鼓励各地加大资助力度，超出中央核定总额部分的国家励志奖学金所需资金由中央给予适当补助。省（区、市）以下分担比例由各地根据中央确定的原则自行确定。
